中廣新聞網9/20報導，有民眾反應，飲料店直接用生水洗珍珠奶茶裡的珍珠，以及為了保鮮有些業者會添加防腐劑，擔心到底吃進多少生菌和防腐劑？林口長庚臨床毒物科醫師林杰樑表示，珍珠奶茶中的珍珠，過去常被發現添加違法防腐劑「去水醋酸」，讓珍珠口感Q，這種物質毒性強，食用過多，民眾要小心傷害染色體基因以及肝腎。
另外，毒物科醫師也表示，香料、色素及人工甘味與防腐劑等，都是在飲料中常見的添加物，如果濃縮果汁裡有添加防腐劑「苯鉀酸鹽」，果汁又含有維他命C的話，兩種成分加在一起可能產生致癌物苯物質的出現。這些飲料不能曝曬或受高溫直曬，萬一又保存不當，在長期過量飲用的情形下，可能增加罹患血癌的機率，建議民眾盡量選擇天然飲品，例如自己打果汁，營養又健康。
部分果汁口味的飲料如木瓜牛奶等，有添加調味料香料粉，雖然合法香料微量不至於危害人體，但有些不肖業者會添加工業級的香料，林醫師說非食用香料吃了，依有害物質的含量與成分不同，對健康有不同程度的影響，民眾買飲料要慎選，看清楚添加物成份。
林醫師指出，如果飲料中添加不合法的人工色素，色素過於強烈的飲料，依據研究，可能讓孩子比較過動、影響學習。又因為飲料需要甜味，糖比較貴，有些業者會選擇糖精、代糖等人工甘味，雖然合法，不可食用過量。因為在動物實驗中，過量會引起膀胱癌，但在規定量裡則屬於安全。
衛生署食品衛生處長鄭慧文則表示，針對手搖飲料店的衛生管控，各地衛生局會定期抽驗包括冰果室、泡沫紅茶與飲料店飲料的生菌數與防腐劑添加物，如果有業者違規，則會依法開罰。