替代蛋白產業的崛起，正在對紐西蘭傳統的畜牧業和農業結構帶來前所未有的挑戰。一項由「蛋白質未來紐西蘭項目」發佈的研究報告指出，替代蛋白如果持續發展，勢必將重塑紐西蘭農業的土地利用格局。
報告概述了四種可能的替代蛋白發展情景。若所有技術障礙得以克服，替代蛋白在口感、價格等方面實現與動物蛋白的全面平手，產業規模快速做大，屆時乳製品生產用地可能減少35%，羊肉和牛肉產區面積也將遭遇25%的縮減，這些土地預計將轉為林地和種植業用途。
相比之下，即使只是植物基製品取得突破，或是發酵技術獲得應用，紐西蘭農業土地利用結構也將發生15%至50%不等的改變。整體來看，無論替代蛋白按何種情景發展，都將給紐西蘭的傳統畜牧業和相關供應鏈帶來重大沖擊。
值得關注的是，替代蛋白產業的興起極有希望為紐西蘭環境帶來根本性改善。報告稱，若大規模採用替代蛋白，紐西蘭的溫室氣體排放、營養流失和磷流失等環境問題都將獲得顯著紓緩。同時，替代蛋白產業的發展也將為紐西蘭創造大量新的就業機會，促進經濟增長。
不過，一些研究人員也擔憂，隨著替代蛋白技術的普及，其他國家自給自足的能力不斷提高，可能會降低對紐西蘭傳統農產品的需求。總的來說，替代蛋白給紐西蘭這個農業大國帶來了雙刃劍般的影響。